Van 18 maart 1876 tot 11 september 1968 is de Hovaeremolen onafgebroken eigendom geweest van de familie Denecker. Maurice en Alfons Denecker hielden de molen draaiende met twee wieken tot 1958. In 1932 werd een motor geplaatst waardoor het herstel na het verlies van een roede (twee wieken) in 1949 minder noodzakelijk was.
In 1968 werd de molen aan de gemeente Koekelare verkocht en in 1973 als monument geklasseerd. De molen takelde verder af en zag er in de jaren '80 zielig uit. In 1992 werd door de vzw Hovaeremolen (eigenaar sinds 1987) de restauratie aangevat.