De Hovaeremolen dateert uit de 17e eeuw. Hij werd ter plaatse gebouwd maar was aanvankelijk een houten molen. De molen is een koren- en oliewindmolen en naast het malen van graan werd ook lijnzaad gemalen met een kleine molensteen onderaan in het molenkot. De wieken hadden een vlucht van 24 meter en dit betekent dat elke wiek 12 meter lang was. Tijdens de Eerste Wereldoorlog deed de molen dienst als uitkijkpost voor de bezetter en onder in de molen was een Duitse legerkeuken geïnstalleerd. Als gevolg van de oorlogsschade werd de molen in 1921 herbouwd tot een stenen molen en achteraf heeft de molen vele jaren met 2 wieken gedraaid. https://www.souvenhiers.be/Media/Detail/7909

In 1958 is de laatste molenaar met pensioen gegaan en staat hij er verlaten bij. https://www.souvenhiers.be/Media/Detail/970

Op 11/09/1968 werd de Hovaeremolen eigendom van de gemeente Koekelare die de molen aankocht voor 125.000 BEF. Sedert vele jaren is de molen een geklasseerd monument, maar geld van de overheid voor de restauratie is er nooit gekomen.

Zeven Koekelarenaars hebben nu het plan opgevat om de molen aan te kopen, te restaureren en open te stellen voor het publiek. De initiatiefnemers stichten een vzw met als naam "VZW De Hovaeremolen".